ゲームをクリアすると以下の要素が解放される。
難易度不問でクリア
- 「SP CONTINUE」が追加（機体、特殊兵装、所持金、フライトデータ、アンロックしたクリア特典を引き継いで始めからプレイ可能になる）。
- 本編の難易度ノーマル以上でネームド機が出現するようになる（ネームド機を撃破すると機体のネームド機カラーが購入可能になる）。
- フリーミッション、フリーフライト、トライアルミッションが追加。
- VSモードにステージ6～8が追加。
- オプションに「シーンビューワー」と「ミュージックプレーヤー」が追加。
- オプションの「SCREEN SETTING」でサイドストーリーのオン・オフを設定できるようになる。
- ミッション中のポーズメニューからHUDのオン・オフを設定できるようになる。
- タイトルムービー（アトラクトムービー）に登場する機体が、F-22Aに代わり一番最近に使った機体になる。
難易度ハードをクリア
- 本編に「難易度エキスパート」が追加。
難易度エキスパートをクリア
- 本編に「難易度エース」が追加。